Per lanciare Spyder come una qualsiasi app installata crea un file ~/.local/share/applications/spyder.desktop e mettici dentro
[Desktop Entry]
Type=Application
Version=4.1.3
Name=Spyder
GenericName=Spyder
Comment=The Scientific Python Development Environment
Icon=/opt/anaconda3/envs/F20/lib/python3.8/site-packages/spyder/images/spyder.svg
Exec=/opt/anaconda3/envs/F20/bin/spyder %F
Terminal=false
MimeType=text/x-python;
Categories=Development;Science;IDE;Qt;
Keywords=Development;Science;IDE;Qt;
StartupNotify=true
StartupWMClass=Spyder
Aggiusta il path delle chiavi Exec ed Icon a seconda di dove hai installato Anaconda e se hai creato un virtual environment separato